2009年6月6日上午，中华中医药学会第五次会员代表大会暨30周年会庆在北京国际会议中心一号厅隆重举行。会议主要任务是总结建会30年来的经验，修订《中华中医药学会章程》，选举产生第五届理事会和领导机构，研讨商定今后5年改革发展的目标与规划。
第十届全国政协副主席李蒙，卫生部党组书记张茅，中国科协副主席齐让，民政部副部长姜力，卫生部副部长、国家中医药管理局局长王国强，卫生部副部长陈啸宏，国家中医药管理局副局长李大宁、马建中，世界卫生组织驻华代表，全国著名中医药专家，中医医疗机构、中医药院校、科研院所、中药企业的相关领导和新闻媒体的代表等约500人参加了本次代表大会。全国人大常委会副委员长陈至立为大会题词。
中华中医药学会第四届理事会会长佘靖在开幕词中总结了30年来办会的成功经验。她说，学会坚持以发展学术为核心，大力开展学术交流活动，设有专科分会68个，团体会员单位147个，会员18.4万人，志愿者1700人，成为规模最大的全国中医药学术团体。先后召开学术会议2142次，交流学术论文14万余篇，主办23种中医药期刊并担任百余种专业期刊的业务指导；制定常见病、多发病及重大疾病防治指南、诊疗规范等263项；设立“中华中医药学会科学技术奖”和“李时珍医药创新奖”，评出获奖项目386项，其中18项获奖成果获得了国家科学技术奖；举办中医药继续教育项目4000余项，培训人员10万余人次；与20多个海外学术团体建立了友好联系，发展海外会员500多名等。
张茅书记在讲话中指出，中医药作为我国医学的特色和重要的医药卫生资源，与西医药优势相互补充，协调发展，共同担负着维护和增进人民健康的任务，是中国特色医药卫生事业不可或缺的重要组成部分。他希望，学会在引领中医药学术方向、继承创新传统医学、促进中医药现代化发展发挥应有的作用，为“人人享有基本医疗卫生服务”做出新的贡献。
王国强副部长在讲话中充分肯定了学会在推动学术发展、实施人才战略、承担社会事务、开展宣传交流、加强自身建设等方面取得的成绩，对今后的工作提出了具体要求。要认真学习贯彻《国务院关于扶持和促进中医药事业发展的若干意见》，进一步统一思想，凝聚共识，抓好落实；要发挥学术引领作用，进一步提升学术活动质量，遵循中医药发展规律，科研与实践相结合，承担创新性政策研究和重大课题研究，提高办刊质量，推进中医药理论和实践的不断进步；要发挥摇篮作用，进一步加强高素质中医药人才培养；要发挥桥梁作用，进一步增强服务社会能力；要发挥凝聚作用，进一步提高自身素质。
通过会员代表选举，王国强当选为中华中医药学会第五届理事会会长，马建中、王新陆、吕玉波、李清杰、孙树椿、严世芸、吴以岭、吴浈、张大宁、张伯礼、李大鹏、李俊德、杨明会、陈传宏、徐镜人、高思华、曹洪欣、谢阳谷当选为副会长，李俊德兼任秘书长。
大会同时举行了“中华中医药学会成就奖”、“中华中医药学会终身成就奖”、“中华中医药学会杰出贡献奖”、“促进中医药学会学术发展奖”、“中华中医药学会科学技术奖”、“李时珍医药创新奖”的颁奖典礼，并对中华中医药学会先进学会干部、先进会员、优秀志愿者及全国各地先进中医药学会、先进专科分会、先进会员单位进行了表彰。
